原位雜交技術（in situhybridization）是以標記的核酸分子為探針，在組織細胞原位檢測特異核酸分子的技術。使含有特異序列、經過標記的核酸單鏈即探針，在適宜條件下與組織細胞中的互補核酸單鏈即靶核酸發生雜交，再以自顯影或細胞化學方法對標記探針進行探測，從而在細胞原位顯示特異的DNA或RNA分子。
可以檢測cRNA、miRNA、LnRNA、DNA。可以各種種屬的標本，包括哺乳動物、爬行動物、菌、植物標本。也可以檢測組織芯片。
植物染色體原位雜交技術的應用非常廣泛。例如，它可以用來研究植物基因組的結構和功能，包括基因定位、染色體重組、基因表達和基因組演化等方面。此外，該技術還可以用來檢測植物中的染色體異常，如染色體缺失、重復和易位等。
植物染色體原位雜交技術的優點在于它可以直接觀察到染色體上的目標DNA序列，而不需要進行PCR擴增或測序等操作。此外，該技術還可以同時檢測多個目標DNA序列，從而提高檢測效率和準確性。
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